PCR實驗總是失敗的原因可能涉及多個方面，包括實驗操作、試劑質量、反應條件、模板DNA質量、引物設計以及實驗室環境等。以下是基于我搜索到的資料對這些原因的詳細分析：

1、引物設計不當：引物設計不合理是導致PCR失敗的常見原因之一。例如，引物特異性差、退火溫度設置不當、引物長度過短或存在二級結構等，都會影響PCR的擴增效率和特異性。此外，引物設計不合理還可能導致非特異性擴增或引物二聚體的形成模板DNA質量不佳：模板DNA的質量對PCR的成功至關重要。如果模板DNA降解、濃度過低或存在污染，都會導致PCR無法正常進行。此外，RNA提取過程中如果未去除RNA，也可能對PCR產生干擾。

2、反應條件不合適：PCR反應條件的設置對實驗結果有重要影響。例如，退火溫度設置過高或過低、循環次數過多或過少、延伸時間不足等，都會影響PCR的擴增效率和特異性。此外，dNTP濃度不一致或Taq酶失活也會導致PCR失敗。

試劑質量問題：試劑的質量和純度對PCR的成功至關重要。如果使用的Master Mix、引物、酶等試劑質量不佳或已過期，可能會導致PCR失敗。此外，試劑配制錯誤或移液不準確也會導致實驗失敗

3、實驗室操作不當：實驗室操作中的不規范行為也是導致PCR失敗的重要原因。例如，操作過程中未嚴格遵守無菌操作規范、使用污染的耗材、儀器未定期校準等，都會影響PCR結果的準確性。此外，實驗人員在操作過程中未注意試管與反應板的緊密貼合、未充分振蕩混合等，也可能導致PCR失敗。

4、樣品污染：樣品在制備、提取或保存過程中可能受到污染，導致PCR出現假陽性或假陰性結果。例如，模板DNA中的雜質或外源DNA污染，都會干擾PCR的正常進行。

PCR耗材選擇不當：PCR耗材的選擇對實驗結果也有一定影響。例如，使用低質量的PCR管或板，可能會引入微量的污染或抑制劑，影響PCR的擴增效率。

PCR儀器故障：PCR儀器的性能和狀態對實驗結果也有重要影響。如果儀器未正確校準或存在故障，可能會導致PCR失敗。